Сюжет кампании никак не связан с оригинальной игрой. Более того, подразумевается, что никакой эпидемии не было. Все шло своим чередом до 2015 года.
В 2015 году Земля подверглась внезапному удару из космоса. Огромный звездолет противника завис на орбите и выпустил более тысячи больших боевых кораблей, каждый из которых своим страшным энергетическим оружием в считанные минуты уничтожал крупный город. Напрасно летчики бесстрашно атаковали корабли пришельцев, даже тараня их. Оружие Земли не наносило пришельцам никакого видимого ущерба. Уничтожив силы ПВО, на планету высадился десант пришельцев, состоящий из киборгов. Они взяли под контроль оружие массового поражения. По тому, как точно наносились удары, можно предположить, что пришельцы начали вторжение после тщательной разведки. За несколько дней войны Земля потеряла около 2-х миллиардов человек. Все крупные города лежали в руинах. Все воинские части были уничтожены. Оружие массового поражения оказалось под контролем агрессоров.
Затем поступило предложение о капитуляции, замаскированное под заботу о человечестве. Дескать, они прилетели через огромное расстояние только для того, чтобы пресечь неминуемую третью мировую войну, которая уничтожит человечество. Поскольку никаких средств для ведения войны не оставалось, оставшиеся в живых высшие должностные лица основных мировых держав, принявшие на себя управление своими странами, приняли предложение. Земля капитулировала.
С первых дней своего воцарения, пришельцы неумолимо стали проводить свою политику. Первым делом под полный тоталитарный контроль были взяты все средства массовой информации. Была уничтожена сотовая связь. Оружие массового поражения было вывезено с Земли и уничтожено в космосе. Все новые образцы техники были запрещены. Образование было объявлено «чумой ХХI века». Все учебные заведения были закрыты.
Через несколько лет в правительство Земли ввели людей. Совместное правление назвали Унией. Пришельцы тщательно подбирали людей в правительство, и еще через несколько лет в Унии было больше людей, чем пришельцев. Однако интересы землян оно никак не защищало. А пришельцы гнули свою линию. Все, что вело к сокращению численности населения, поощрялось тайно или явно. Сквозь пальцы смотрели на торговлю наркотиками и оружием. С бандами не боролись, если те сами не нападали на Унию.
Разгул бандитизма привел к образованию отрядов повстанцев. Поначалу они сражались только с бандами. Но Уния сразу объявила повстанцев мятежниками, и начала против них планомерную войну. На планете разгорелась гражданская война. К такому повороту событий пришельцы оказались не совсем готовы. Выпускать против небольших отрядов повстанцев свои огромные корабли было нецелесообразно и они начали вооружать Унию. Была создана сеть военных училищ, был налажен выпуск некоторых видов устаревшей боевой техники. Поскольку управление техникой потребовало определенной грамотности, было введено начальное образование.
Со временем на фронтах гражданской войны все стабилизировалось. То повстанцы разгромят базу войск Унии, то Уния разгромит отряд повстанцев. А население тем временем все более сокращалось. Данное положение устраивало Справедливых Правителей – так пришельцы повелели себя называть. Более 20 лет назад уже все правительство состояло из людей, но вело политику, угодную пришельцам.
Более 10 лет назад пришельцы вообще перестали снисходить до разговоров с людьми, передавая свои приказы через киборгов.
И вот, возвращаясь из долгого разведывательного рейда, объявленный Унией врагом №1, Странник, находясь уже в полукилометре от своих товарищей, нелепо попался в лапы жандармов. В то же время, находящийся в самоволке курсант Андрей Трубин, попадается тем же жандармам…
